Ingénieur de recherche - plateforme de bioinformatique F/H

Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au coeur de Paris, elle présente une organisation avec des directions inter-facultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Ile-de-France et en régions.

Fonctions : Ingénieur-e de recherche au sein d'une plateforme de bioinformatique
Emploi-type : A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Catégorie : A
Corps : IGR
BAP : A

Poste ouvert aux titulaires et aux contractuels (CDD de 3 ans).
A pourvoir à compter du 1er septembre 2026 .

Au sein de la plateforme d'Analyse Bioinformatique, la mission de l'ingénieur-e est d'analyser les données « omique » en collaboration avec les biologistes, de former les utilisateurs aux méthodes d'analyse, de développer les outils informatiques et de mettre en place et maintenir des services WEB proposés aux équipes de recherche (serveurs Galaxy, serveur d'environnement de programmation R ou python, serveurs de stockage, etc).

Activités principales :

• Concevoir, développer et diffuser les outils d'analyse bioinformatique de la plateforme
• Assurer le bon fonctionnement de son infrastructure informatique
• Conduire des projets de développement technologique
• Participer à la veille scientifique et technologique de la plateforme
• Concevoir et proposer des solutions d'analyse adaptées aux biologistes
• Concevoir et diffuser et animer les actions de formation de la plateforme
• Participer aux actions organisées par les réseaux auxquels la plateforme est affiliée (IFB, IBISA, France-Génomique, Réseau Omique de SU)
• Participer à la rédaction de dossiers dans le cadre des demandes de financement

Connaissances transversales requises :

• Organisation et fonctionnement de la recherche et de l'enseignement supérieur en France
• Organisation et fonctionnement de Sorbonne Université
• Réglementation applicable à son domaine d'activité professionnelle
• Statuts, règlements et procédures de gestion des personnels des établissements publics d'enseignement supérieur et de recherche

Savoir-faire requis :

• Maîtrise de la programmation Python et/ou R
• Maîtriser les techniques d'analyse de données (réduction de la dimension, clustering, régression, tests.)
• Expertise d'analyse dans au moins un des domaines suivants: single-cell RNAseq, transcriptomique spatiale, épigénomique
• Capacité à interagir avec les biologistes (bases solides en génomique)
• Capacité à prioriser les développements planifiés et les demandes des utilisateurs
• Capacité à proposer des solutions d'analyse en face d'un problème de biologie
• Savoir communiquer ses résultats à des non spécialistes
• Maîtriser l'anglais scientifique (niveau B2 requis)

Savoir-faire transversaux :

• Capacité à hiérarchiser et à prioriser les tâches et organiser son activité en tenant compte des contraintes et des échéances
• Capacité à conduire et accompagner un projet
• Capacité à élaborer des outils d'analyse et de synthèse et en rendre compte
• Capacité à définir des indicateurs de suivi et à analyser les résultats

Savoir-être :

• Bon relationnel et sens du travail en équipe
• Organisation et rigueur
• Sens du service public